Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL3Q8ND23 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms