Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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RNF169Q8NCN4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF169Q8NCN4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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