Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HJURPQ8NCD3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms