Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CHCHD4Q8N4Q1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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