Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LMNTD2Q8IXW0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LMNTD2Q8IXW0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms