Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNL1Q8IU54 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms