Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT2

VPS37D, Vacuolar protein sorting-associated protein 37D, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37DQ86XT2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VPS37DQ86XT2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VPS37DQ86XT2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms