Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMC4Q7Z404 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMC4Q7Z404 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms