Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACNA2D4Q7Z3S7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms