Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTZ2

USP17L1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L1Q7RTZ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP17L1Q7RTZ2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
USP17L1Q7RTZ2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms