Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTF1AQ7RTS3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTF1AQ7RTS3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms