Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC80Q76M96 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms