Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
USP43Q70EL4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP43Q70EL4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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