Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS12Q6ZW61 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS12Q6ZW61 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms