Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDZRN4Q6ZMN7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms