Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FOXD4L3Q6VB84 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOXD4L3Q6VB84 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms