Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMCO3Q6UWJ1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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