Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC62Q6P9F0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC62Q6P9F0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms