Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-203ENST00000495596 1976 ntTSL 1 (best)10.73□□□□□ -0.691e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-202ENST00000394349 878 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.811e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 ATP5G2-207ENST00000552120 511 ntTSL 1 (best)6.4□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 36.9
PRPF8Q6P2Q9 NOP53-209ENST00000599253 689 ntTSL 210.87□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 36.9
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PRPF8Q6P2Q9 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 36.8
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PRPF8Q6P2Q9 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 36.8
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PRPF8Q6P2Q9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 36.8
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PRPF8Q6P2Q9 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.651e-8■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.691e-8■■■■■ 36.7
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PRPF8Q6P2Q9 FAM76B-211ENST00000543641 1379 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.29e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ANAPC11-220ENST00000584197 386 ntTSL 522.24■■□□□ 1.151e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR3-210ENST00000512760 1431 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.769e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.599e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.551e-18■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-203ENST00000340183 1799 ntTSL 1 (best)18.31■□□□□ 0.529e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 SHCBP1-205ENST00000566016 1482 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.467e-9■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR3-201ENST00000342820 2153 ntTSL 1 (best)17.89■□□□□ 0.459e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.449e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-209ENST00000480773 742 ntTSL 317.62■□□□□ 0.419e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-211ENST00000492619 2029 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.419e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 YME1L1-204ENST00000396296 986 ntTSL 517.44■□□□□ 0.389e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-206ENST00000468632 2023 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.379e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.359e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-207ENST00000470198 759 ntTSL 316.91■□□□□ 0.39e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 STAMBP-205ENST00000424659 583 ntTSL 316.73■□□□□ 0.279e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.239e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-208ENST00000475507 622 ntTSL 516.44■□□□□ 0.229e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 NSD2-217ENST00000508299 592 ntTSL 216.16■□□□□ 0.189e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.179e-10■■■■■ 36.7
PRPF8Q6P2Q9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 36.7
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