Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CAVIN1Q6NZI2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CAVIN1Q6NZI2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms