Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH7

SWSAP1, ATPase SWSAP1, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWSAP1Q6NVH7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWSAP1Q6NVH7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SWSAP1Q6NVH7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms