Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
MYOM3Q5VTT5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
MYOM3Q5VTT5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms