Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM47AQ5JRC9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM47AQ5JRC9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms