Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLE1Q53GS7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLE1Q53GS7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms