Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD55Q3KP44 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms