Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NBPF8Q3BBV2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NBPF8Q3BBV2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms