Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC27Q2M243 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms