Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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CCDC142Q17RM4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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CCDC142Q17RM4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC142Q17RM4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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