Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTL8BQ17RB0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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