Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFKFB3Q16875 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFKFB3Q16875 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms