Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
DDR2Q16832 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DDR2Q16832 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms