Protein–RNA interactions for Protein: Q16829

DUSP7, Dual specificity protein phosphatase 7, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP7Q16829 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DUSP7Q16829 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DUSP7Q16829 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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