Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CDKN3Q16667 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CDKN3Q16667 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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