Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FSCN1Q16658 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN1Q16658 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms