Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ECM1Q16610 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
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