Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNAPC1Q16533 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNAPC1Q16533 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms