Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DDB1Q16531 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DDB1Q16531 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
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