Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ASIC2Q16515 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms