Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP6AP1Q15904 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATP6AP1Q15904 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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