Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
VAMP3Q15836 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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