Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHRNA6Q15825 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CHRNA6Q15825 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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