Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SKIV2LQ15477 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SKIV2LQ15477 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms