Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDGFRLQ15198 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDGFRLQ15198 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms