Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
GAPVD1Q14C86 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GAPVD1Q14C86 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms