Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC10A1Q14973 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms