Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GPNMBQ14956 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPNMBQ14956 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms