Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFIXQ14938 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFIXQ14938 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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