Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHD4Q14839 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHD4Q14839 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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