Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBE4AQ14139 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
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UBE4AQ14139 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBE4AQ14139 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
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