Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BFSP2Q13515 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BFSP2Q13515 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms